Lima Perguruan Tinggi tertua yang ada di Indonesia adalah Universitas Indonesia (UI), Universitas Islam Indonesia (UII), Universitas Airlangga (Unair), Institut Teknologi Bandung (ITB) dan Institut Pertanian Bogor (IPB).
- Universitas Indonesia (UI), berdiri tahun 1947. Berawal dari 1851, Pemerintah Hindia Belanda mendirikan sekolah yang ditujukan untuk menghasilkan asisten dokter, dengan gelar dokter Djawa. Kemudian pada 1898 sekolah tersebut dinamakan School tot Opleinding van Indiche Artsen (STOVIA). Sekolah kedokteran ini sempat beberapa kali berganti nama, yang akhirnya pada 1947 barulah dinamakan dengan UI dan diresmikan pada 1955 sesuai dengan Undang-undang Nomor 10.
- Universitas Islam Indonesia (UII). Dengan nama awal Sekolah Tinggi Islam pada 1945, memiliki program studi mengenai agama Islam, yang kemudian berubah menjadi UII pada 1948. Selain menjadi univesitas tertua di Yogyakarta, UII juga merupakan salah satu universitas swasta tertua di Indonesia.
- Universitas Airlangga (Unair), berdiri tahun 1954. Awalnya merupakan Sekolah Kedokteran bentukan Belanda, School tot Opleinding van Indiche Tandartsen (STOVIT). Merupakan sekolah kedokteran gigi pertama di Indonesia.
- Institut Teknologi Bandung (ITB), berdiri tahun 1959. Awalnya bernama Technishe Hooge School (THS) yang saat penjajahan Jepang berubah nama menjadi Bandung Kogyo Daigaku.
- Institut Pertanian Bogor (IPB). Berdiri tahun 1963. Perguran tinggi ini juga didirikan oleh Belanda. Terdiri dari lima disiplin ilmu, yakni pertanian, kehutanan, dan kedokteran hewan. Sekolah pertanian (Landbouw Hogesschol) ini sempat bernaung pada Universiteit van Indonesia (UI).